MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子，它们在动植物中参与转录后基因表达调控。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种繁芜的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来风雅调控某个基因的表达。
MicroRNA的非常表达与肿瘤的发生发展密切干系，TCGA数据库里面microRNA仅有表达定量信息，对付靶基因预测、组间差异表达等剖析须要其余的网站赞助及手工进行处理，非常不便于研究。本日小诺就给大家先容一个门户级别的网站，一次可以知足大家多个需求，这个数据库便是YM500v2
http://ngs.ym.edu.tw/ym500v2/index.php
YM500v2紧张功能模块
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YM500v2打开的界面如下，我们可以看出紧张包括了六个功能模块，分别是：已知miRNA表达水平查询、新的miRNA预测、miRNA异构体剖析、5’和3’miRNA搜索、组间miRNA差异表达比较及剖析结果下载。下面我们针对每个功能模块进行逐一先容。
一、已知miRNA表达水平查询
分别供应了单个miRNA、多个miRNA、按照miRNA聚类和特定区域miRNA等四种查询办法。个中单个miRNA表达查询最为简洁，分别供应了该miRNA在不同种类组织里面表达水平及表达量分布等信息。
多个miRNA表达查询须要选择标本类型（可多选），查询返回的是样品来源类型及表达量信息，点击 ex pression 按钮之后会自动画出热图及供应表达水平量数据的下载。
按照miRNA聚类查询因此候选miRNA作为中央选择100Kb以内的miRNA作为候选凑集，然后进行多个miRNA查询。特定区域miRNA表达查询和前面的类似，在这里就不详细讲述了。
二、新的miRNA预测
可以供应序列或者按照基因组位置信息进行预测，预测方法是基于miRDeep2，Mireap和miRanalyzer三个软件，只要有一个预测到就会显示出来。此外点击UCSC等数据库链接还能看到序列在基因组的情形。
三、miRNA异构体剖析
我们以example的hsa-miR-21-5p为例进行搜索。
里面包括了详细的miRNA编辑位点及基于测序reads的支持情形，还有简并碱基情形。点击每条异构体会供应表达量分布及每个样品表达水平等详细信息（以下划线的异构体为例）。
四、5’和3’miRNA搜索
搜索之后返回同一条miRNA前体产生的两条不同miRNA差异表达情形，不同颜色的点代表不同类型的样品，在蓝线之外的便是具有差异表达的样品。
五、组间miRNA差异表达比较
选择两个group样品类型及填写邮箱信息，然后提交任务即可。任务完成之后会邮件关照剖析完成，打开邮件链接即可看到剖析结果（数据只能保存7天），并且所有剖析结果都可以下载。
来源：永诺生物
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