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php花生技巧_花生基因组测序的前世今生

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基因组组装

php花生技巧_花生基因组测序的前世今生

2. 2016年5月31日 PNAS在线揭橥了山东省农业科学院牵头的花生A亚基因组先人蔓花生(Arachis duranensis ) (accession PI475845)的基因组的论文(https://doi.org/10.1073/pnas.1600899113)。
全部二代数据组装。

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(图片来自网络侵删)

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基因组组装

3. 2017年12月22日 福建农林大学庄伟建教授课题组在线开释了栽培花生狮头企的基因组序列(http://210.34.81.125/index.php)。
2017年12月26日 美国团队不甘掉队,紧急开释了栽培花生Tifrunner的基因组序列(https://www.peanutbase.org/)。
这两个是不同的栽培花生,文章在2019年正式揭橥在NG上。
二代三代数据结合组装。

文章先容

4. 2018年5月3日 广东农科院梁炫强研究院团队揭橥了野生B基因组Arachis ipaensis (ICG_8206) (B-genome)的序列(https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00604)。
全部二代数据组装。

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5. 2018年5月24日 河南农业大学殷冬梅教授团队揭橥了唯一野生四倍体花生Arachis monticola的基因组序列(https://doi.org/10.1093/gigascience/giy066)。
二代三代数据结合组装。

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6. 2019年3月19日 广东农科院梁炫强团队揭橥了我国花生地方品种伏花生(Fuhuasheng)的基因组序列(https://doi.org/10.1016/j.molp.2019.03.005)。
二代三代数据结合组装。

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至此,花生属基因组已经宣布了

四套野生二倍体供体种基因组(2个AA,2个BB)。
全部二代数据,质量还需提高。

一套野生四倍体基因组 Arachis monticola。
二代三代结合,组装质量可以。

三套栽培种基因组!
狮头企 Tifrunner 伏花生。
二代三代结合,组装质量可以。

U.S. Agency for International Development Feed the Future Peanut项目主任Dave Hoisington表示:“花生序列可以被看作是植物遗传学和基因组学的巨大飞跃,同时它也是发展中国家向稳定农业迈出的一大步。
随着花生基因组序列的发布,研究职员将有更好的工具来促进更高产量和更好营养的花生新品种选育。

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