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本日
1.LncLocator数据库

http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/lncLocator/
用来在线预测lncRNA亚细胞定位,只须要输入核苷酸序列,即可得到LncRNA在细胞质、细胞核、核糖体、胞质溶胶、外泌体这5个位置的分布比例。
干系文献
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序列输入
输入核苷酸序列(这里我们就以网站举例的序列为例),然后点击“submit”:
结果展示
提交后,就知道该LncRNA在这5个位置的详细评分了,预测结果选取评分最高的位置,比如:这个预测结果就在细胞质(Cytoplasm)中。
2. iLoc-LncRNA数据库
http://lin-group.cn/server/iLoc-LncRNA/predictor.php
用来在线预测lncRNA亚细胞定位,只须要输入核苷酸序列;这个数据库比较于LncLocator数据库有一个上风:可同时预测多个LncRNA。
干系文献
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数据输入
可以输入多个LncRNA序列(这里以网站自带序列为例):
结果展示
3.RNALocate数据库
http://www.rna-society.org/rnalocate/
RNA亚细胞定位检索工具(这个数据库不单单适用于lncRNA,其他的RNA也可以),这个数据库与之前的两个数据库比较,仅输入名称即可,会更方便,还可链接到预测结果的干系文献、数据库等。
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数据输入
输入LncRNA名称即可(这里以LncRNA UCKL1-AS1为例):
结果展示
首先点进去涌现的界面会展示该LncRNA的基本信息,包括名称、RNA ID号、RNA类型等,点击“GO”即可链接到详细的预测结果
接下来会以表格形式展示检索结果的简要信息,紧张包括RNA种别、物种、组织/细胞、亚细胞定位结果等,点击“detail”,就可看到结果更详细的信息
以检索结果第一个为例,可看到详细的参考文献信息、数据库等
3个数据库都给大家附有链接,打开链接就可得到3种预测lncRNA亚细胞定位的方法,是不是又收成满满啊;同时呢,3个数据库也给大家附有干系参考文献,在写作时候也可以直接引用,有没有很方便呢~
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